Bakterie jsou jedním z nejzajímavějších mikroorganismů ve všech těch, které jsou studovány z mikrobiologie. Vyšetřování, která mají tyto mikroskopické a jednobuněčné bytosti jako protagonisty, mají obecně přímý dopad na různé oblasti zájmu vědy a všech druhů lidských činností, od medicíny po zemědělství.
Pokud vezmeme v úvahu výživu prokaryot, najdeme všechny možnosti přítomné u živých bytostí. Není divu, že bakterie jsou prvními organismy přítomnými na Zemi a za miliardy let, kdy se vyvinuly, se přizpůsobily všem možným prostředkům a formám výživy.
Heterotrofy, většina prokaryotických buněk je heterotrofních. To znamená, že získávají své jídlo začleněním organické hmoty tvořené jinými živými bytostmi. Z nich většina jsou saprofyty, což znamená, že se živí mrtvou organickou hmotou a přispívají tak k recyklaci hmoty v ekosystémech.
Mohou provádět aerobní katabolismy - s využitím kyslíku - a anaerobní, prostřednictvím fermentací, z nichž mnohé jsou užitečné pro náš průmysl.
Existují heterotrofní bakterie, které žijí spojené s jinými organismy a mají vzájemný prospěch, takže by byly symbiotické. Jasným příkladem je Escherichia coli, bakterie, která žije v zažívacím traktu člověka. Mnoho býložravců může využívat celulózy díky mikrobiální flóře v trávicím traktu, která obsahuje enzym celuláza. Další symbióza je u některých rostlin s bakteriemi, které fixují atmosférický dusík (Rhizobium), přičemž rostlina využívá část dusíku fixovaného bakteriemi, která zase využívá část rostlinných cukrů.
Mnoho dalších jsou paraziti, využívají organickou hmotu této jiné živé bytosti, která způsobuje ztrátu; to je případ všech patogenních bakterií, které způsobují onemocnění. Některé patogeny (chlamydie, křivice a některé mykoplazmy) zjednodušily svou strukturu a mohou se množit pouze v jiné buňce: jsou to obligátní paraziti.
V exotické skupině myxobakterií, typu kluzkých bakterií, které mají schopnost agregovat několik buněk za vzniku struktur, které jim umožňují migraci, patří i některé, které jsou predátory jiných bakterií.
Bakterie se živí těmito zdroji a jak jsme již poznamenali, jejich strategie přežití jsou velmi rozmanité. Bezpochyby jsou všechny příkladem evoluční adaptace v celé historii a jsou jimi dodnes a mají zásadní roli v přírodě a životních cyklech naší planety.
