Etymologie slova fylogeneze pochází z řeckého „phylon“, což znamená kmen nebo rasa, a „gen“, což znamená produkovat nebo generovat, je to odvětví biologie, které je zodpovědné za studium původu a vývoje druhů způsobem globální. Termín poprvé použil biolog Ernst Haeckel v roce 1866, tato část biologie ratifikovala teorie navržené biology Charlesem Darwinem a Alfredem Russelem Wallaceem, podle nichž živé bytosti nezůstávají nezměněny, ale vyvíjejí se v průběhu času čas.
Tato věda sdílí myšlenku, že všechny živé bytosti mají společného předka, a jak bylo zmíněno, studuje vztahy, které existují mezi různými organismy, a snaží se zjistit potomky nebo příbuzenství, které mohou existovat mezi jedním a druhým. V současné době se v důsledku vývoje v oblasti o genetice, podobností a rozdílů mezi jednoho druhu a další lze studovat efektivněji.
V průběhu let byla sdílena myšlenka, že se živé bytosti vyvíjejí v důsledku mutací DNA, aby se lépe přizpůsobily prostředí, v některých případech tyto mutace ustupují novým druhům, ale v jiných těchto Modifikace DNA mění pouze určitou vlastnost, která pomůže druhu adaptovat se na svůj ekosystém.
Aplikace fylogeneze v současnosti umožnila velký pokrok ve vědecké a medicínské oblasti, příkladem toho je studium mitochondriální sekvence, také při detekci původu nakažlivého onemocnění při srovnání kmenů bakterií a viry.
