Tento termín má různé koncepty, každý bude záviset na vědecké specializaci, kde je aplikován. Například v biologii je epigeneze stará teorie o mechanismu, kterým se vyvíjejí lidské bytosti, tj. Embryo se vyvíjí od zygoty, která dosud nebyla rozlišena, což ukazuje na neexistenci miniaturních prvků, orgánů které jsou již přítomny v gametách.
Tato teorie je v rozporu s teorií preformace, která uvádí, že vývoj embrya představuje růst již vytvořeného organismu. Nicméně , podle epigenezí, orgány, které tvoří embryo jsou vytvořeny z ničeho, přes podněty odvozené od okolního prostředí.
Tato teorie interpretuje mechanismus konečného ladění, pomocí kterého je každá bytost spojena, efektivním způsobem do svého prostředí, počínaje kapacitami obsaženými v jejím genetickém kódování. Protože geny jsou obecně součástí poněkud komplikované sítě interakcí, které udržují zpětnou vazbu. A proto nepostupují samostatně.
V celé historii vždy probíhala debata, která konfrontuje epigenetickou teorii s preformací. Preformationismus však končí, ve stejném okamžiku, kdy technologie dokázala ukázat epigenetický původ orgánů. Je třeba dodat, že tato debata byla jednou z nejhistoričtějších, jaké kdy byly viděny, konala se během devatenáctého století.
Nyní, v oblasti mineralogie, termín epigenezí je používán se odkazovat na modifikaci chemické povaze jednoho minerálu, aniž by bylo nutné měnit jeho strukturu.
