Ve vědecké oblasti je methylenová modř známá jako methylthioninchlorid, jedná se o barvivo používané jako barvivo k pigmentaci některých částí těla člověka před nebo během operace. Lékaři jej v zásadě používají jako antiseptikum a vnitřní kauterizátor.
Používá se také jako barva na skvrny pro pozorování prováděná mikroskopem a pro malování výsledků v laboratořích, protože má schopnost barvit moč a výkaly. Nakonec se také používá při léčbě ke snížení methemoglobinu. Mezi jeho vlastnosti patří to, že se jedná o prvek složený z krystalů, jasně tmavě zelené barvy, bez zápachu a nemění se vzduchem.
Může být snadno rozpuštěn ve vodě a obezřetně v alkoholu a při kontaktu s nimi se jeho barva změní na tmavě tmavě modrou, také se používá k boji proti plísním nehtů, může se také použít k malování bílého oblečení, když je začíná nažloutnout.
V akvakultuře je široce používán k léčbě infekcí u tropických ryb, je velmi účinný v boji proti parazitům prvoků, který způsobuje infekce ryb. V zásadě se používá k péči o vejce, která nedávno položila ryba, aby nebyla infikována žádnými bakteriemi nebo houbami, je velmi užitečná, pokud chcete vajíčka uměle inkubovat. Lidé si mohou koupit methylenovou modř bez lékařského předpisu, obvykle se používá jako lokální antiseptikum.
