Aerobní mikroorganismus je popisován jako typ organismu, který má striktní potřebu žít diotomický kyslík, aby mohl žít, je klasifikován jako fakultativní aerobní organismus, když může nebo nemůže žít s přítomností kyslíku.
Adjektivum aerobní nejen aplikovat na klasifikaci organismu, může být také používán k popisu prostředí nebo metabolické reakce, označit to název „aerobním prostředí“ a „aerobního metabolismu“ v tomto pořadí, v obou případech se kyslík Je přítomen v hojném množství (označuje se jako mikroaerofilní prostředí, když je kyslík v malém množství, ale vůbec neexistuje), jako příklad aerobního metabolismu lze uvést fotosyntézukyslík, který přispívá velkým množstvím kyslíku do prostředí, jehož kyslík využívají eukaryotické buňky díky přítomnosti mitochondrií, které mají na starosti provádění buněčného dýchání.
Tento termín se používá hlavně při klasifikaci patogenních mikroorganismů, jako jsou bakterie, aeobní bakterie, jak naznačuje jejich příjmení, mají potřebu obývat prostředí bohaté na křemelinový kyslík, aby mohli včas růst, proliferovat a diferencovat, to znamená, že jsou druhem bakterií kteří provádějí buněčné dýchání, můžeme je podle potřeby kyslíku rozdělit do několika skupin: přísné aerobní bakterie (obligátní aeroby), které k provádění svých metabolických procesů vyžadují kyslík, fakultativní anaerobní bakterie mohou využívat kyslík a naopak také bez něj, mikroaerofilní bakteriepoužívají kyslík v nízkých koncentracích, aerotolerantní bakterie mohou žít v přítomnosti kyslíku, ale nepoužívají ho metabolicky.
