Mikroorganismy lze definovat jako druh živých bytostí malé velikosti do té míry, že jsou pro lidské oko neviditelné. Mohou to být různé typy, mezi nejdůležitější patří řasy, houby, bakterie atd. Existují lidé, kteří zachovávají hypotézu, že některé mikroorganismy byly předchůdci života na planetě Zemi, zatímco jiné poněkud komplikovanější předpoklady potvrzují, že jsou mimozemského původu a že se v té době rozšířily přes tvář planety a život ke všemu, co je dnes. Obecně je velmi běžné, že mikroorganismy jsou tvořeny buňkou jedinečný, to však neznamená, že neexistují ty, které se skládají z více než jedné buňky.
Vedeno potřebou čelit nemocem mělo studium mikroorganismů velký impuls, proto se medicína vyvinula stejným způsobem jako znalosti o těchto živých bytostech.
Některé mikroorganismy jsou považovány za odpovědné za újmu určitých potravin, které mohou být škodlivé pro ty jedince, kteří tyto potraviny konzumovali, a způsobovat různá onemocnění, přesto existují určité mikroorganismy, které mohou přispět k různým postupům, příkladem toho je fermentace, kde se uvedené organismy používají k výrobě potravin, jako je jogurt nebo sýr, to znamená, že existují mikroorganismy, které mohou změnit konfiguraci určitých potravin nebo dokonce prodloužit jejich životnost.
Mikroorganismy, které mají v přírodě největší přítomnost, jsou bakterie, které lze nalézt na různých typech stanovišť. Existují bakterie, které mohou být škodlivé pro lidské zdraví, například „ Escherichia coli “, který je zodpovědný za nemoci, jako je septikémie. Navzdory tomu existují další bakterie, které mohou být tělu prospěšné, příkladem je „Lactobacillus acidophilus“, který má schopnost produkovat různé látky, jako je vitamin K a peroxid vodíku, což může velmi pomoci organismus.